Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms