Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
TtrP07309 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TtrP07309 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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