Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dgcr6O35347 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms