Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm17333C6EQI3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17333C6EQI3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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