Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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