Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms