Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAGR1Q9BTK6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms