Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas3Q8CCN5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms