Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nek5Q7TSC3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms