Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms