Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mc1rQ01727 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms