Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms