Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nbr1P97432 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms