Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd12P23812 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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