Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NlkO54949 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NlkO54949 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NlkO54949 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NlkO54949 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NlkO54949 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NlkO54949 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NlkO54949 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NlkO54949 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NlkO54949 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms