Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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