Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3173A6NAS3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3173A6NAS3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms