Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms