Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms