Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKIRAS1Q9NYS0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKIRAS1Q9NYS0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms