Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CYI0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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