Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp16Q99LG0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms