Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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