Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CARMIL3Q8ND23 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms