Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms