Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms