Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms