Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ube2d3P61079 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d3P61079 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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