Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSFMP43897 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms