Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms