Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms