Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHBP21953 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms