Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r58G3X9U3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms