Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

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Length 1,231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Alpk1Q9CXB8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alpk1Q9CXB8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms