Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms