Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
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