Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALCAMQ13740 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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