Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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