Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms