Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NficP70255 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NficP70255 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms