Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms