Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PrkchP23298 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms