Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms