Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms