Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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