Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms