Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms