Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gde1Q9JL56 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms