Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nsmce3Q9CPR8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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