Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms